Mechanistic models are built using knowledge as the primary information source, with well-established biological and physical laws determining the causal relationships within the model. Once the causal structure of the model is determined, parameters must be defined in order to accurately reproduce relevant data. Determining parameters and their values is particularly challenging in the case of models of pathophysiology, for which data for calibration is sparse. Multiple data sources might be required, and data may not be in a uniform or (...) desirable format. We describe a calibration strategy to address the challenges of scarcity and heterogeneity of calibration data. Our strategy focuses on parameters whose initial values cannot be easily derived from the literature, and our goal is to determine the values of these parameters via calibration with constraints set by relevant data. When combined with a covariance matrix adaptation evolution strategy, this step-by-step approach can be applied to a wide range of biological models. We describe a stepwise, integrative and iterative approach to multiscale mechanistic model calibration, and provide an example of calibrating a pathophysiological lung adenocarcinoma model. Using the approach described here we illustrate the successful calibration of a complex knowledge-based mechanistic model using only the limited heterogeneous datasets publicly available in the literature. (shrink)

Bijdragen over de visie van de Frans-joodse filosoof (1906-1995) op het kwaad.

Analyse dans la perspective phénoménologique de l'essence comme expression de "l'être" différent de l'"étant". Substitution, dans la subjectivité, de soi à autrui.

Reproduit quatre conférences faites en 1946 et 1947 sous ce titre au Collège de philosophie, et interroge la notion de temps comme limitation même de l'être fini ou comme relation de l'être fini à Dieu (Electre).

Qu’est-ce qui peut venir à l’idée qui n’y soit pas déjà, en quelque façon, contenu, ou qui ne soit pas déjà à la mesure de l’idée? Ne faudrait-il pas, pour rendre pensable l’absolu – pour trouver un sens à Dieu – contester que la pensée soit coextensive à la conscience en guise d’un savoir toujours corrélatif de l’être et, dès lors, que la philosophie coïncide avec l’ontologie?Ce livre essaie de suggérer que le sens signifie non pas exclusivement sous la figure (...) de signifiants – choses, signes, mots – renvoyant à des signifiés; qu’il signifie, plus anciennement, à partir du visage humain, comme quand on dit signifier un ordre ou ordonner. Signifiance originelle du visage perçant sans cesse ses formes plastiques et représentées qui sans cesse se referme sur la voix silencieuse ou inouïe du commandement signifié! Eveil et dévotion suscités en guise d’un moi libéré de soi, libéré pour le prochain, même si l’on s’obstine à n’y trouver que représentation et conscience de soi. (shrink)

" Le besoin d'évasion écrit Emmanuel Lévinas, nous conduit au cœur de la philosophie. Il nous permet de renouveler l'antique problème de l'être en tant qu'être... " C'est dore que, dans ce texte, il choisit - à la faveur d'un thème fortement heideggerien - d'aller à la rencontre des questions qui, toujours, ont guidé sa quête : le besoin d'évasion n'est-il pas le propre d'un être fini? N'aspire-t-il pas à franchir les limites de l'être plutôt qu'à le fuir? Et (...) pourquoi l'être aurait-il besoin de sortir de soi? Sur tous ces points, la méditation d'Emmanuel Lévinas s'affirme ici souveraine et féconde. A s'y engager, tout lecteur se rapprochera de la vérité de son destin au cœur d'une modernité tragique et opaque. (shrink)

La question de Dieu dans la pensée de Husserl fut très tôt un objet d'attention pour la recherche phénoménologique, mais la diversité des textes est telle qu'il était nécessaire d'établir le dossier historique relatif à cette question. Bien évidemment, la mise en lumière de l'unité et de la continuité des analyses de Husserl sur Dieu est animée par une interrogation proprement spéculative : quelle place pour Dieu dans une philosophie descriptive qui se veut méthodologiquement athée? A partir du "je" transcendantal, (...) quel est l'accès possible à la pure phénoménalité de Dieu? Si Husserl décrit la transcendance de Dieu comme celle d'une Idée théorique, éthique et téléologique, il ne s'agit pas pour lui de s'en tenir aux reconstructions abstraites de la métaphysique, niais de revenir à l'expérience originaire de Dieu. La réduction phénoménologique ne demande pas de cesser de croire, mais elle rend possible une purification éthique de l'expérience religieuse qui permet d'élucider son sens. En cela, tout le projet contemporain d'un concept non ontologique de Dieu est redevable à Husserl d'avoir fait le premier pas décisif en affranchissant de tout en soi " et en montrant que la transcendance de Dieu ne peut être séparée de la vie intentionnelle dans laquelle elle s'annonce. Husserl ne confond pas pour autant philosophie et théologie, et la compréhension de Dieu comme évidence d'une Idée pratique infinie laisse ouverte la possibilité de la Révélation sans vouloir parler pour elle. (shrink)

L’esprit contemporain nous vole nos intériorités. Il entend façonner nos goûts et nos imaginaires. Orienter nos expériences. Nous détourner de nous-mêmes dans un divertissement généralisé, une mise en réseau et un art consommé de l’inquiétude qui est une autre manière de nous emporter dans son flux. C’est un homme mutilé, abruti, amoindri spirituellement que produit ce monde dominé par la technique qui ose appeler progrès les0régressions qu’il programme. L’art – entendu non comme savoir ou culture mais comme passion de la (...) liberté et exploration de nos sources enfouies – est l’un des derniers moyens qui nous restent pour nous savoir humains. Tout art digne de ce nom est insurrection, quête d’absolu, tentative désespérée pour dire l’amour incommensurable qui nous taraude. Emmanuel Godo, ici, nous provoque et nous convoque. Et si nous faisions l’épreuve de notre humanité – pour en avoir la preuve – en nous confrontant à des oeuvres d’art? Mais pas à des simulacres sans épaisseur ou à des joujoux insipides, non! Car ce n’est pas en millions de dollars que s’évalue une oeuvre mais à sa capacité à faire se lever en nous nos forces en sommeil. Un plaidoyer magistral pour l’art contemporain, le vrai. (shrink)

Deux cours. Les deux derniers professés par Emmanuel Lévinas en Sorbonne, durant l'année universitaire 1975-7976. Deux cours qui sont comme une glose méditative autour de quelques mots : Dieu, la mort, le temps. En ouverture, la mort et le temps. Pour la première fois, ces deux notions qui parcourent l'œuvre entière du philosophe sont longuement explicitées. Parallèlement, Lévinas renoue avec sa recherche sur le mot Dieu, inversant les termes du diagnostic heideggerien : lorsque la philosophie a confondu, dès son (...) origine, Dieu et l'être, ce n'est pas tant le second qui a été oublié, c'est d'abord le premier qui a été éclipsé. La tâche de la pensée revient alors à libérer Dieu de l'emprise métaphysique. Au final, ces deux textes éclairent sous un autre jour et à partir d'un angle nouveau trois des thèmes majeurs de la réflexion d'Emmanuel Lévinas. Mais ils reviennent aussi, au gré d'une parole vagabonde, sur d'autres notions fondamentales de l'œuvre : la responsabilité, Autrui, la patience, le Dire, la transendance, le témoignage... (shrink)

Les soixante-dix nations : tel était le thème choisi par le 27e colloque des intellectuels juifs de langue française. Quel sens prenait pour le judaïsme, conscient de procéder de l'Histoire sainte, sa présence à l'Histoire universelle, auprès des nations et parmi elles? Ce thème avait déjà été approché au cours de quatre rencontres précédentes. Le présent ouvrage reproduit les cinq " lectures talmudiques " qu'Emmanuel Levinas donna devant cet auditoire de 1981 à 1986. S'y ajoutent des textes consacrés à (...) l'exégèse rabbinique touchant l'amour du prochain et de l'étranger, au concept de " kénose ", mais aussi aux problèmes de l'intégration et de la distance que pose au judaïsme l'Europe issue du siècle des Lumières. Un débat réunissant en Hollande des penseurs juifs et chrétiens permet de souligner la féconde originalité, sur ce plan, de la pensée de Franz Rosenzweig. Et un entretien avec Françoise Armengaud aborde quelques thèmes essentiels de la philosophie juive dans le cadre de la philosophie générale. (shrink)

La personne comme question est un sujet qui n'a cessé d'alimenter la réflexion de l'auteur, ceci en s'appuyant sur Husserl. De la préhistoire du concept de personne à son épanouissement médiéval puis jusqu'à sa réactivation phénoménologique, la personne est un combat pour le soi. La perspective généalogique adoptée dans ce livre vise à montrer que c'est la genèse du concept biblique de personne qui montre le véritable sens d'être de la personne, alors que le concept juridique en est dérivé. Citant (...) les auteurs clé de ce concept de personne, ce livre en retrace l'histoire. (shrink)

La musique constitue un terrain privilégié permettant d'explorer de nouvelles émotions et de vivre les échanges humains sous de nouveaux modes de communication.

La 4ème de couv. indique : "Avec "Hors sujet", Emmanuel Levinas revient et approfondit sa réflexion sur le noyau dur de sa philosophie : la relation avec l’Autre. Méditation superbe qui entraîne vers l’analyse des "Droits de l’homme et droits d’autrui", une approche singulière du "Langage quotidien" et de la "rhétorique sans éloquence", ou encore de "La Transcendance des mots". En chemin, le philosophe retrouve la trace de ceux auprès desquels il a fortifié sa propre pensée – Merleau-Ponty, Jankélévitch, (...) Leiris, mais aussi Martin Buber, Franz Rosenzweig ou Jean Wahl. Une magistrale leçon de philosophie.". (shrink)

Le projet de modernisation nationale que le libéral radical Eloy Alfaro prétend réaliser à son arrivée au pouvoir, en 1895, accorde aux femmes un rôle inédit en Équateur. Elles ne doivent plus seulement être épouses et mères, mais devenir actrices du changement idéologique et économique depuis l´espace public. Les considérant comme moteur du progrès, les libéraux leur accordent des droits inédits : accès au marché du travail, accès à l´éducation, droits juridiques. Toutefois, la portée des réformes est limitée et le (...) regard sur les femmes et leur rôle évolue très lentement. Néanmoins, le libéralisme lance une dynamique dans l´émancipation des Équatoriennes dont témoigne l´émergence d´un sujet féminin défendant ses droits à participer aux affaires publiques. (shrink)

Cet article propose une nouvelle enquête sur l ’ ancien concept de preuve rhétorique. Seront examinées les notions suivantes : le tekmerion (l ’ indice), le paradeigma (l ’ exemple) et le topos (lieu), afin d ’ éclairer leur lien apparemment paradoxal avec la persuasion et la validité. Le propos est de montrer qu ’ un tel paradoxe peut être résolu grâce à une conception stratifiée de la rationalité, où la raison archaïque soutient la persuasion, tandis que la raison moderne (...) fonde la validité. (shrink)

André Malraux, le conquérant aveugle.--Albert Camus; ou, L'appel des humiliés.--Perspectives existentialistes et perspectives chrétiennes.--Un surnaturalisme historique: Georges Bernanos.

La crise de l’art sacré n’est pas conjoncturelle, mais elle appartient bien à sa tension constitutive entre l’intention propre à l’art et la volonté de refléter la parole de Dieu. En prenant comme fil conducteur le sacré chrétien, il s’agit de montrer que l’art est un chemin pour comprendre le sacré autrement que comme une valeur ou que comme une catégorie. Mais en retour, le sacré est un chemin pour comprendre que l’art n’est pas image. En cela l’art sacré est (...) un art impossible au sens où il ne vise pas à représenter des possibles déterminés par l’homme, mais à être médiateur entre Dieu et l’homme et entre les hommes. L’incarnation est alors la vérité de l’art sacré qui doit sans cesse chercher des chemins nouveaux en tant qu’il est un acte fondamental de la liturgie. L’art sacré ne représente pas, il rappelle aux hommes leur tâche d’être, qui est une tâche commune. (shrink)

Husserl explore la possibilité de considérer la relation comme une véritable catégorie contre l’empirisme et l’intellectualisme. Les relations ont une réalité et ne sont pas des produits de l’intellect. Cet article envisage la position de Husserl dans la sixième des Recherches logiques sur le statut ontologique de la relation. L’intuition catégoriale de la relation est un tournant décisif dans l’histoire du concept de relation.

BackgroundThe ARRIVE (Animal Research: Reporting of In Vivo Experiments) guidelines are widely endorsed but compliance is limited. We sought to determine whether journal-requested completion of an ARRIVE checklist improves full compliance with the guidelines.MethodsIn a randomised controlled trial, manuscripts reporting in vivo animal research submitted to PLOS ONE (March–June 2015) were randomly allocated to either requested completion of an ARRIVE checklist or current standard practice. Authors, academic editors, and peer reviewers were blinded to group allocation. Trained reviewers performed outcome adjudication (...) in duplicate by assessing manuscripts against an operationalised version of the ARRIVE guidelines that consists 108 items. Our primary outcome was the between-group differences in the proportion of manuscripts meeting all ARRIVE guideline checklist subitems.ResultsWe randomised 1689 manuscripts (control: n = 844, intervention: n = 845), of which 1269 were sent for peer review and 762 (control: n = 340; intervention: n = 332) accepted for publication. No manuscript in either group achieved full compliance with the ARRIVE checklist. Details of animal husbandry (ARRIVE subitem 9b) was the only subitem to show improvements in reporting, with the proportion of compliant manuscripts rising from 52.1 to 74.1% (X2 = 34.0, df = 1, p = 2.1 × 10−7) in the control and intervention groups, respectively.ConclusionsThese results suggest that altering the editorial process to include requests for a completed ARRIVE checklist is not enough to improve compliance with the ARRIVE guidelines. Other approaches, such as more stringent editorial policies or a targeted approach on key quality items, may promote improvements in reporting. (shrink)

Dans le "Manifeste au Service du Personnalisme" d'Emmanuel Mounier, le philosophe français expose les principes fondamentaux du personnalisme. L'ouvrage défend la primauté de la personne humaine dans la société et explore comment le personnalisme peut influencer la politique, l'économie et la culture. Mounier appelle à une réflexion approfondie sur la dignité et la responsabilité individuelles, cherchant à promouvoir une société où chaque personne est reconnue et respectée dans sa singularité. Ce manifeste offre une vision philosophique engagée en faveur de (...) la place centrale de l'individu au sein de la communauté. (shrink)

Le terme de « personne » est devenu aujourd’hui très abstrait, y compris dans le personnalisme, et il est nécessaire de lui redonner le statut d’un vrai concept. Une telle tâche est rendue possible par la méthode de la phénoménologie qui seule peut être attentive à l’identité propre de la personne par rapport à l’identité de la chose. Contre le concept juridique de personne et contre les pensées de l’identité personnelle issues de Locke, Husserl permet de montrer en quoi l’identité (...) personnelle n’est pas simplement l’identité passée formée par le souvenir, mais qu’elle est l’identité présente que le sujet se donne dans le temps, dans la chair et dans la vie de la volonté. Heidegger, lui, permet de faire un pas de plus dans l’analyse du caractère concret de la personne en montrant que, antérieurement au sujet qui se forme lui-même, la personne est cet être qui découvre ses possibilités les plus propres à partir de sa vie dans le monde ; la personne est alors ce qu’elle a à être. Il est ainsi possible, en se libérant de toute idée de constance, de retrouver la dimension relationnelle et responsive de la personne qui était au centre de la philosophie médiévale.The term of « person » has become very abstract today, as well in personalism, ant it is necessary to regive it the status of a concept. This has been made possible by the method of phenomenology which alone can be attentive to the actual identity of the person compared with the identity of thing. Against the juridical concept of person, and against the philosophy of personal identity since Locke, Husserl shows how the personal identity is no simply our past identity formed by the memory, but that it is the present identity that the subject develops over time, in the life and flesh of our will. Heidegger allows to go one step further in the analysis of the concrete character of the person by showing that prior to the subject that forms itself, the person is his being who discovers his own possibilities from what he experiences in life ; the person thus becomes what he has to be. It is necessary to show, free ourselves from all idea of constancy, that person is defined by relation and reply. (shrink)